马超课题组

发布日期:2018-01-08 来源:本站

AD大脑基因和蛋白质组数据库及遗传标记物研究

截至2017年12月4日,脑组织样本收集共计197例。其中男性111例,女性86例。年龄范围4个月~102岁,中位数81岁,65岁以上老年人155人。有痴呆病史者28人,帕金森病病史者4人,其他神经精神疾病,如脑梗塞,精神分裂,病史者26人,无神经经神疾病史者139人。目前已完成神经病理诊断105例,根据国际标准诊断流程(Montine, T.J., et al., Acta Neuropathol, 2012,123(1):1-11.)进行“ABC”AD样病理表现评分,评分为“高”者16例,“中”者26例,“低”者36例,无AD样病理表现者27例。65岁老年人中无痴呆、帕金森及其他神经精神疾病史且“ABC”评分为“低”或“无”者,33例,可作为健康老年对照。18~65岁无病史且“ABC”评分为“低”或“无”者30例,可作为健康成年人对照。

自2016年10月开始对新鲜脑组织进行海马分区取材,分别取内嗅皮质、海马(CA1、CA2、CA3和DG区)和前额叶皮层。共计完成病理诊断19例,其中“ABC”评分为“高”者3例,“中”者11例,65岁以上健康老年对照组5例,健康成人对照组2例。

以脑库样本为基础,分析了日常认知与神经病理“ABC”评分的关系,发现了认知障碍与Neuritic plaque的相关性,文章已被Current Alzheimer Research杂志接收(Qiu W, Yang Q, Zhang W, Wang N, Zhang D, Huang Y, Ma C. The Correlations Between Postmortem Brain Pathologies and Cognitive Dysfunction in Aging and Alzheimer’s Disease. Curr Alz Res 2017 Nov 6. doi: 10.2174/1567205014666171106150915. [Epub ahead of print])。提取了AD与对照额叶组织RNA,利用piRNA芯片证实了人脑组织中piRNA的存在,并发现了103个在AD与对照组中表达水平差异大于1.5倍,为后续研究AD的相关遗传标志物奠定基础(Transcriptome-wide piRNA profiling in human brains of Alzheimer’s disease. Neurobiology of Aging 57 (2017) 170-177; Genome-wide significant, replicated and functional risk variants for Alzheimer’s disease. J Neural Transm (2017) 124: 1455)。

蛋白质组学方面基本按照研究计划完成:

(1)分离获得4例AD患者和4例健康对照的海马的CA1区,CA2区,CA3区,CA4(含DG)区,内嗅皮层区的冰冻标本。

(2)提取各区域的蛋白。

(3)进行AD患者和健康组海马各分区的TMT标记定量蛋白质组学实验。其中CA1区重复3次实验,CA2区,CA3区,CA4(含DG)区,内嗅皮层区各重复2次实验。

(4)生物信息学分析。

目前共获得22套蛋白质组学数据,1篇文章正在提交,1篇文章正在撰写。